Listino Prezzi Analisi Genomiche

Servizio di Analisi Genomiche per il Miglioramento Genetico delle Varietà e la Tracciabilità Genetica degli Alimenti – Laboratorio di Genomica c/o DAFNAE

Referente scientifico: Prof. Gianni Barcaccia

Responsabile tecnico di Laboratorio : Dott. Francesco Scariolo

Estrazione e purificazione di DNA genomico totale ad alto peso molecolare

€30 / campione
€180 / 12 campioni

Isolamento di DNA genomico da impiegare per reazioni di restrizione e amplificazione mediante mini-prep

Isolamento di DNA genomico con sistema automatizzato (96 campioni)

€576 / tessuti vegetali
€480 / tessuti animali

Isolamento di DNA genomico da tessuti animali e vegetali in piastra da 96 campioni (>20 ng/ul, totale 1-2 ug)

Analisi OGM: ricerca di DNA transgenico mediante PCR (Saggio quali-quantitativo)

€84 / campione
€600 / campioni (>10)

Analisi del DNA estratto da campioni di alimenti e mangimi per la ricerca dei principali eventi transgenici registrati e presenti in commercio

Mappaggio genetico di caratteri qualitativi (MAS)

€1500 / 8 campioni
€2520 / 16 campioni
€3960 / 96 campioni

Selezione genetica di individui con particolari caratteristiche fenotipiche mappando marcatori molecolari associati ai geni corrispondenti

Miglioramento genetico assistito da marcatori (MAB): SSR genotyping (4 loci)

€360 / campione
€1200 / 16 campioni
€2400 / 96 campioni

Tipizzazione genetica mediante marcatori SSR usando loci microsatelliti mappati (neutrali e/o espressi) attraverso analisi elettroforetica capillare

Analisi della struttura genetica di popolazioni tramite marcatori co-dominanti PCR-derivati:

€1080 / 8 campioni
€1620 / 16 campioni
€4200 / 96 campioni

Calcolo indici di diversità genetica e coefficienti di similarità genetica, gradi di omozigosi/eterozigosi, determinazione di matrici di distanze genetiche, costruzione di alberi NJ e UPGMA, definizione di aplotipi e genotipi

Caratterizzazione genetica di linee parentali (analisi di stabilità e diversità genetica) (4 loci):

€480 / 8 campioni
€720 / 16 campioni
€2400 / 96 campioni

Analisi dei parametri ACG e ACS in relazione al grado di uniformità genetica entro e diversità genetica tra linee parentali di varietà sintetiche (Syn1) e varietà ibride (F1) utilizzando marcatori SSR mappati: 1 per braccio cromosomico del genoma X della specie

Test DUS di varietà monogenotipiche (linee pure, ibridi F1 e cloni):

€1680 / 24 campioni
€3960 / 96 campioni

Analisi dei parametri DUS ovvero distinguibilità, uniformità e stabilità, necessari per l'iscrizione delle varietà al registro nazionale o comunitario delle varietà di specie agro-alimentari utilizzando marcatori SSR mappati: 1 per braccio cromosomico del genoma X della specie

Tracciabilità genetica di prodotti agro-alimentari (nuDNA haplotyping):

€60 / campione
€360 / 8 campioni
€600 / 16 campioni

Analisi di marcatori SNP di geni nucleari singola-copia per la definizione di aplotipi varietà specifici

Identificazione genetica di specie da matrice organica (cp/mtDNA barcoding):

€60 / campione
€360 / 8 campioni
€600 / 16 campioni

Analisi di marcatori SNP di geni Cox1 e CytB e rbcL e trnH-psbA in matrici agro-alimentari di origine animale e vegetale

Next-Generation Sequencing (NGS) con piattaforma Ion Torrent

Identificazione genetica di specie da matrice organica (Saggio quali-quantitativo) per mezzo di sistemi di meta-barcoding:

€240 / campione
€1800 / 8 campioni
€3360 / 16 campioni

Analisi di campioni alimentari a matrice complessa per la determinazione delle specie animali contenute nel prodotto e loro determinazione semi-quantitativa

Genotipizzazione tramite Sequenziamento (GBS) con protocolli ddRADseq (reads <300bp):

€4800 / 12 campione
€6600 / 24 campioni
€8400 / 48 campioni
€11040 / 96 campioni

Preparazione di librerie con protocollo ddRADseq per il sequenziamento di ~1000-2000 loci genomici per la determinazione delle varianti nucleotidiche ed aplotipiche utili ad indagini DUS, MAB e identificazione varietali

Genotipizzazione tramite Sequenziamento (GBS) con protocolli ddRADseq (reads <500bp):

€5400 / 12 campioni
€7440 / 24 campioni
€9600 / 48 campioni

Cito-fluorimetria a flusso

Analisi del livello di Ploidia e della dimensione del Genoma:

€180 / campione vs. testimone (3 repliche)
€1200 / 10 campioni (3 repliche)

Determinazione del livello di ploidia (2x, 3x, 4x, ecc.) e della dimensione del genoma (Mpb) di piante mediante citometria a flusso (Flow cytometry, FCM)

Analisi dati genomici per la determinazione delle statistiche genetiche

Elaborazione dati PCR derivati:

€84 / 16 campioni
€360 / 96 campioni

Elaborazione dati NGS:

€240 / 12 campioni
€360 / 24 campioni
€720 / 96 campioni