Servizio di Analisi Genomiche per il Miglioramento Genetico delle Varietà e la Tracciabilità Genetica degli Alimenti – Laboratorio di Genomica c/o DAFNAE
Responsabile: Prof. Gianni Barcaccia
€115 / 16 campioni
Isolamento di DNA genomico da impiegare per reazioni di restrizione e amplificazione mediante mini-prep
(96 campioni)
Isolamento di DNA genomico da tessuti animali e vegetali in piastra da 96 campioni (>20 ng/ul, totale 1-2 ug)
Analisi del DNA estratto da campioni di alimenti e mangimi per la ricerca dei principali eventi transgenici registrati e presenti in commercio
Selezione genetica di individui con particolari caratteristiche fenotipiche mappando marcatori molecolari associati ai geni corrispondenti
Caratterizzazione genetica con marcatori AFLP usando combinazioni di enzimi/primer EcoRI/MseI e PstI/TaqI attraverso analisi elettroforetica capillare
Tipizzazione genetica mediante marcatori SSR usando loci microsatelliti mappati (neutrali e/o espressi) attraverso analisi elettroforetica capillare
8 campioni
Calcolo indici di diversità genetica e coefficienti di similarità genetica, gradi di omozigosi/eterozigosi, determinazione di matrici di distanze genetiche, costruzione di alberi NJ e UPGMA, definizione di aplotipi e genotipi
Analisi dei parametri ACG e ACS in relazione al grado di uniformità genetica entro e diversità genetica tra linee parentali di varietà sintetiche (Syn1) e varietà ibride (F1) utilizzando marcatori SSR mappati: 1 per braccio cromosomico del genoma X della specie
Analisi dei parametri DUS ovvero distinguibilità, uniformità e stabilità, necessari per l'iscrizione delle varietà al registro nazionale o comunitario delle varietà di specie agro-alimentari utilizzando marcatori SSR mappati: 1 per braccio cromosomico del genoma X della specie
Analisi di marcatori SNP di geni nucleari singola-copia per la definizione di aplotipi varietà specifici
Analisi di marcatori SNP di geni Cox1 e CytB e rbcL e trnH-psbA in matrici agro-alimentari di origine animale e vegetale
Identificazione genetica di specie in prodotti alimentari di diversa origine a partire da qualsiasi matrice solida e liquida, e relativa quantificazione
Determinazione del livello di ploidia (2x, 3x, 4x, ecc.) e della dimensione del genoma (Mpb) di piante mediante citometria a flusso (Flow cytometry, FCM)